राष्ट्रीय अनुसंधान एजेंसी (NIA) ने अमृतसार मंदिर के ग्रेनाडा द्वारा हमले के मामले में तीन प्रतिवादियों के साथ लोड किया है। निया, मोहाली की विशेष अदालत के समक्ष दायर अपने आरोपों में, निया ने विशाल गिल @ चुची, भागवंत सिंह @ मन्ना भट्टी और दीवान सिंह @ सनी पर हमले की साजिश और निष्पादन में उनकी भूमिका के लिए आरोप लगाया, जो कि थाकुर्वारा सनातन के मंदिर में किया गया था। विशाल गिल साइकिलों द्वारा प्रेषित दो हमलावरों में से एक थे, जिन्होंने 15 मार्च, 2025 के शुरुआती घंटों में ग्रेनेडा को फेंक दिया था। अन्य हमलावर, गुरसिदक सिंह @ सिडकी, हमले के दो दिन बाद एक पुलिस बैठक में मारे गए थे। आरोपों के अनुसार, भागवंत सिंह @ मन्ना भट्टी ने हमलावरों को शरण, सुरक्षित छिपे हुए छुपाने, तार्किक मान्यता के लिए मोटरसाइकिल प्रदान करने और हमले से पहले और बाद में समर्थन प्रदान करने में प्रदान किया था। दीवान सिंह @ सनी को बंदरगाह के बंदरगाह और साक्ष्य के विनाश में उनकी भूमिका के लिए पदों के साथ लोड किया गया है। एक अन्य प्रमुख आरोपी, शरनीजीत कुमार को 5 सितंबर, 2025 को निया डी गया, बिहार ने गिरफ्तार किया था। RC-08/2025/NIA/DLI मामले पर एजेंसी की जांच ने भी UPI और MTSS चैनलों के माध्यम से स्थानीय संचालन में विदेशी प्रबंधकों के आतंकवादी धन के हस्तांतरण का खुलासा किया है, जिनकी जांच की जा रही है। मामले में अन्य बेड़े की पहचान करने और हमले में शामिल आतंकवादी मॉड्यूल के अंतरराष्ट्रीय संबंधों को ट्रैक करने के प्रयास किए जाते हैं, भारत और विदेशों में स्थित आतंकवादी एजेंटों द्वारा लोगों के बीच भय पैदा करने और पंजाब और देश के बाकी हिस्सों में सामुदायिक असहमति को उकसाने के उद्देश्य से एक बड़ी साजिश का हिस्सा।